对花卉病虫害的防治，不能单纯依赖化学农药，而是需要根据花卉种植地的实际情况，将检疫、栽培制度、抗病虫品种选用、合理的园林管理操作，与物理的、生物的和化学的防治方法相结合，制定有效的综合防治措施，具体应遵循以下几个原则：
一、遵守农药安全使用规则
在花卉栽培中，禁止使用的农药有：甲胺磷、甲基对硫磷、对硫磷、久效磷、磷铵、六六六、滴滴涕、毒杀芬、二溴氯丙烷、杀虫脒、二溴乙烷、除草醚、艾氏剂、狄氏剂、汞制剂、砷、铅、敌枯双、氟乙酰胺、甘氟、毒鼠强、氟乙酸钠、毒鼠硅等。
二、采取安全防护措施
施药人员必须做好规定的安全防护措施，防止中毒。剩余的药液和施药器械的清洗液，应集中安全处理，不得随意泼洒。不允许重复使用空容器，应妥善收集和处理空容器，将空容器加以标示安全存放，或集中处理。
废弃和过期的农药，必须按国家相关规定处理，不能随便丢弃，以免使花卉产生药害，或使人畜中毒。
三、科学栽培减少用药
通过耕作措施，能消灭部分病虫，形成不利于病虫发生的条件。同时，应提高花卉抗病虫的能力，如进行田园清洁、处理病残体、减少病虫的来源、合理密植、增加温室或大棚的通风透光、及时排除渍水、降低田间湿度、科学配方施肥等，使花卉健壮生长，提高其抗病虫能力。
四、加强物理防治
为避免病虫抗药性的产生，应尽量选择物理防治。例如，可采用悬挂黄色粘虫板来诱杀蚜虫和潜叶蝇，在田间铺挂银灰色膜驱避蚜虫，同时提高光照强度。利用许多夜间活动的昆虫有趋光性的特点，采用灯光诱杀、食饵诱杀等方法消灭害虫，还可以采用防虫网来减少害虫发生的几率。
五、开展生物防治
生物防治也是减少用药、避免花卉产生抗药性的一个措施。
一是利用能使害虫致病、致死的细菌、真菌、病毒或它们的代谢物来防治虫害。通常是人工培养害虫的致害微生物，然后制成粉剂喷洒，使害虫致死。如细菌制剂中的苏云金杆菌对鳞翅目昆虫的幼虫毒性极强，杀灭效果极佳。试验结果表明，利用真菌灭虫的效果也很好。如用白僵菌寄生在鳞翅目、鞘翅目等昆虫及蜗类体内，能极有效地杀灭害虫。白杨虱赤座霉菌对粉虱有极高的致病力。利用病毒治虫的研究和应用同样取得了很大的进展，应用较多的是核多角体病毒。昆虫病毒的专化性很强，致病力也强，效果持久。实际应用中常将病毒制剂制成水剂、铂剂、可湿性粉剂等，喷施或施入土壤中防治虫害。
二是利用微生物间的拮抗作用及某些微生物的代谢产物，来抑制花卉致病微生物的生长、发育，甚至使其致死。这类物质即为抗生素。如代号为“5406”的花菌肥能防治花卉的某些真菌病害、细菌病害以及花叶病毒病。
三是利用自然界中的生物链、食物链关系或寄生关系来防治害虫。例如，利用日光蜂防治棉蚜；利用蜻蜓、螳螂等捕食害虫等等。
还可利用植物免疫力以及植物液汁中的有效成分来防治病虫害。如用蒜汁水溶液能防治不少种类的病菌。利用植物生理活性物质来防治病虫害是目前国内外研究的重点，是前景很好的方法之一。此外利用生物工程方法防治病虫害也是一种新的发展趋势，如转基因技术等。
