与一期工程相比，二期工程更注重打好生态“补丁”，提升森林质量，因地制宜种植油松、侧柏、落叶松、元宝枫、山桃、山杏等乡土树种。同时，加大栎类、桑树等景观和食源树种种植的比例，以生态办法解决生态问题。
近年来，随着京津风沙源治理、播草盖沙、平原百万亩造林等工程的不断推进，全市五大风沙危害区已经得到彻底治理，沙化土地全部被绿树覆盖，首都环境质量持续改善，正逐步实现“绿水青山就是金山银山”。
据北京市园林绿化局防沙治沙办公室负责人介绍，北京市的沙化土地主要分布在永定河、潮白河、大沙河、延庆康庄地区和昌平南口地区等“五大”区域，总面积247.5万亩，治理前景观环境差，风沙活动频繁，当地百姓总结为“无风一片沙，有风地搬家，每当风沙起，处处毁庄稼。”
从上世纪80年代开始，北京市通过开展“三北”防护林工程建设、农田林网、重点风沙危害区绿化造林等工程，大规模防沙治沙，成效明显。进入新世纪，根据生态建设需要，又陆续实施了京津风沙源治理、播草盖沙、平原百万亩造林等生态工程，为治理风沙危害，改善城乡生态环境，促进农民致富增收做出了突出的贡献。
据统计，自京津风沙源治理工程2000年启动以来，全市在门头沟、怀柔、密云等区已累计完成造林营林812万亩，构建了首都北部抵御风沙的第一道防线。工程区森林覆盖率达到52%，林木绿化率达到72.8%，分别比2000年增加12.2和15.4个百分点，京津风沙源治理工程的贡献率达到90%以上。工程开展的7个区先后被评为国家级生态示范区。
从2012年开始的平原百万亩造林工程，在五大风沙危害区加大生态修复力度，治理废弃砂石坑、卵石滩地25.3万亩，营造防风固沙、景观游憩多功能森林，彻底改变了五大风沙危害区的环境面貌。
在多年播草盖沙的基础上，2017年实施永定河下游郊野段河道播草治沙项目，在总长22公里永定河下游郊野段河道内实施播草8389亩，种植沙地柏、马鞭草等2万株，使永定河下游郊野段河道裸露沙地实现全面覆盖，有效地防止了本地扬沙，并提升了区域景观效果。
据北京观象台沙尘资料统计分析：上世纪50年代北京市沙尘最严重，春季沙尘日数平均多达26天；60年代至80年代，沙尘日数有所下降，在10至20天之间波动；90年代以后至本世纪初，沙尘日数明显下降，在5至7天左右；2010年以后平均沙尘日数在3天左右，风沙渐离北京城。
“巩固防沙治沙工程成果，要坚持治沙与治穷相结合，不仅要让沙地变绿，还要让当地百姓在参与生态建设中受益。”据介绍，仅以门头沟区为例，自2000年至2017年底，该区完成京津风沙源治理工程130.17万亩，森林覆盖率由2000年25.1%增加到45.73%，提高20.63个百分点。荒山变绿之后不仅抗风沙能力和景观效果明显增强，其涵养水源、净化水质、保持水土和抵御自然灾害的能力也明显提高。经统计，项目区造林地共累积固定肥力约2319.2万吨，造林地植被年直接固碳量为5351.7吨，直接涵养水源累积1.6亿吨，山区的生态屏障基本形成。依托京津风沙源工程，全区栽植经济树种21456亩，使全区果树资源面积达6.8万亩，建成观光采摘果园100余个。据统计，果农人均年收入达到4.2万元，蜂农人均年收入达到3.5万元，同比2013年约增长25%。同时通过生态林管护实现绿岗就业的有5662人，人均月收入达到638元，并保持每3年提高10%的稳定增长机制。
京津风沙源治理紧抓生态这条主线，将“治沙与治穷”相结合，正所谓“绿水青山就是金山银山”。
