芝麻是生育期较短，投资不大，见效较快，但产量不稳定，特别是渍害与草害常成为制约产量的重要因子。芝麻生育阶段正处于多雨季节，产生渍害又导致草荒，使土壤孔隙置于水分饱和缺氧状态。同时会诱发病害，致使芝麻大幅度减产。轻者减产10%~20%，重者减产50%以上，严重的甚至还会造成绝收。
芝麻苗期受渍后的为害症状：一是田间缺苗断垅，二是幼叶发黄滞长，三是部分根茎基部发生猝倒死苗或滋生根腐病，四是排渍后恢复生长缓慢，千粒重和含油量下降，单株蒴果减少30%左右。芝麻盛花期受渍的为害症状：一是使根系变黑有臭味，二是使叶片萎蔫，三是使花与蒴果的发育受到抑制，四是千粒重和含油量下降。终花期受渍涝的为害症状，一是渍后3天左右叶片严重萎蔫，二是根系由褐变黑，吸水吸肥功能减退，三是种子中空瘪率高，千粒重大大下降，含油量下降8%左右，四是减产幅度大，高达60%左右。可见，芝麻苗期、盛花期受渍所受的损失以减少产量为主，终花期不但影响产量，而且含油量的变幅很大。
受渍后的芝麻田，特别是没有施用除草剂的，常常会杂草丛生，草比芝麻苗多。常见的杂草有旱稗、狗尾草、马唐、马齿苋等。晴天人工除草后，芝麻苗子生长纤弱，植株下部蒴果锐减，对产量影响很大。
芝麻对水是非常敏感的作物，水是芝麻的命也是芝麻的病。要想夺取芝麻增产丰收，有经验农民常规法宝之一，就是芝麻要增收，关键开好沟。对此，一要选择保水排水条件好的大田种植芝麻；二要采用窄厢（畦）深沟播种芝麻，土壤要整细，厢（畦）面要整成鲫鱼背状，防止厢（畦）面渍水；三要开好田间厢沟、腰沟、和围沟，做到明水能排，雨住田干。每次降雨之后，都要及时清沟排渍。
对于芝麻的田间杂草，可采用多种除草剂喷施：一可在播种前5~7天每亩用48%氟乐灵乳油100~150毫升，兑水50千克喷施，随即用齿耙将药与土混合，然后播种。二可用48%甲草胺乳油，每亩150~250毫升，兑水75~100千克于芝麻播种之后出苗之前喷施于土壤表层。三可用48%甲草胺乳油100毫升+敌草隆可湿性粉剂100克喷施。四可用50%乙草胺乳油70~80毫升，兑水75~80千克斤喷施。五可用10.8%吡氟乙草灵乳油25~30毫升，兑水15~20千克于芝麻出土之后杂草有3~4片叶时喷施，均能取得较好防治杂草效果。
