百合育种方法有四种，各种育种方法及其特点如下：
（1）规模扦插：广泛用于百合育种，成熟秋天或春天。将百合鳞茎干燥数天，然后将鳞片剥离，倾斜地插入粗砂或颗粒状泥炭中，并且顶部表面略微暴露。通常，在春季扦插，大多数根和叶可以在2到4个月后生根，并且在鳞基中产生小球。如果季节是扦插，则温度保持在约20℃，并且在超过一个月之后可以从伤口产生生根球。从鳞片的生根到植物开花需要3到4年的时间。
（2）球分：这是繁殖百合花的常用方法。具体方法是采用适当的深种植和去除花芽，促使植物将土壤埋在茎部，生长许多子球，或在花中。谢谢之后，将茎切成小块，埋在湿沙中，露出叶子。大约一个月后，子球从叶腋生长;在播种球之前，将子球培养1至3年。
（3）植物性芽：适用于火山和鼠尾草等叶芽的叶芽种类。该方法是在花蕾开始脱落之前将芽取出并存放在沙子中。它也可以立即播种到苗床。在正常施肥和管理条件下，培养2〜3年，即可开花。
（4）播种;适合百合，麝香百合和一些杂交种。具体方法是在果实成熟后立即取出扁平种子，立即播种，或者在秋季或第二年春季贮藏。
