随着现代生物工程技术的进步和生物制品商业化生产水平的提高，近几年生物农药在农业生产上愈来愈广泛地被应用，并且收到了较好的效果。但是，很多农民对生物农药认识模糊。
有的认为，施用生物农药后可以不用化学农药了，或者说化学农药的时代要结束了，把生物农药与化学农药对立起来；有的认为不施用生物农药的食品不能称之为无公害的食品，片面强调生物农药的作用；有的认为，生物农药好是好，就是慢，直观效果差，给急于防虫治病的农民留下无效的印象；有的农民将生物制剂Bt与剂或酸性复配液混用，使防效丧失。所有这些都有碍于生物农药健康有序地推广应用。因此，应对生物农药有一个认识，并且要掌握正确使用的技术。
首先，应该看到生物农药的先进性
生物农药的内容很多，它包括微生物农药、生物化学农药、转基因生物农药、天敌生物农药以及植物源农药。应用生物农药，一可杀灭多种病虫，二可生产无公害的绿色食品，三可减少对环境的污染，确保人畜，四可保护天敌，五是病虫不易产生抗药性。但生物农药仅是农药组成部分之一，目前尚不能取代化学农药。
其次，要了解生物农药的作用机理
生物农药对病虫的毒害有一个渐进的过程。如Bt，首先麻痹害虫神经，然后破坏其内脏致死，需要1-3天的时间。再如昆虫病毒，是病毒粒子的核酸进入害虫体内，吸取虫体内营养，致使细胞组织解体死亡，需要3-5天。尽管生物农药的直观效应比化学农药要慢，但施药后病虫的危害功能已受到抑制，或者名存实亡。因此，必须根据这些农药的特性合理施用。
第三，要正确施用生物农药
一是要严格根据当地植保部门的病虫发生预报，提前几天施用生物农药；二是要严格按照施用剂量用药，不可随意增加或降低施用浓度；三是为了提高防效和性能，可与部分低毒化学农药混用，尽量减少高毒农药的公害。但Bt禁止与剂和酸性复配液混用，也不能在桑园施用；四是不能将生物农药暴晒或受潮；五是选择在晴天下午用药或阴天用药，药后遇雨须重喷1次。