小麦茎基腐病一般暖冬情况下是2-3月中旬会出现次发病高峰，第二个高峰可能发生在回暖后的4月中旬至5月中旬。病株率一般达到60%以上，严重的可达84.2%。造成严重减产。
一、小麦茎基腐病害特征
小麦茎基腐病是小麦生产中一种典型的土传病。也可以通过种子传播。病菌孢子可以在土壤中存活过冬，温度适宜后在土壤表面萌发，病原菌一般从根部和根茎结合部侵入，侵染小麦主茎和分蘖茎，然后随着小麦的生长发育扩展至小麦茎基部。
?该病具有多次侵染特点。小麦茎基腐病，属于真菌性病害。前期危害后的明显特征就是根部发生褐变，根部1-2节呈褐色，严重的时候变成深褐色，开始死亡。湿度大或中后期的小麦根部可能会出现红色或白色霉层。如果没有及时防治，后期会直接表现在灌浆期，小麦上部穗出现枯白穗，穗小籽少，根部容易折断现象。
二、小麦茎基腐病防治方案
茎基腐病堪称是小麦的绝症，发病后如果没有及时防治，后期几乎绝收，所以农民朋友一定要把重点放在预防上，下面给大家总结几个有效的预防方法：
1.轮作换茬。重病田改种大蒜、圆葱、棉花、大豆等经济作物。多年小麦-玉米连作，或者连续几年秸秆还田，秸秆带菌残体中的致病菌在土壤中不断累积。这是小麦茎基腐病爆发和病症越来越重的根源。
2.选用抗病品种。不同品种对该病反应有明显差异。选择抗病基因优良的种子这无疑是经济有效的办法。
3.播种前使用杀菌剂对种子进行处理。可以种子包衣或药剂拌种。药剂可以选用：多菌灵+苯醚甲环唑；多菌灵+嘧菌酯；咯菌腈+精甲霜灵；咪鲜胺铜盐+精甲霜灵拌种，能够有效预防茎基腐病发生。
4.药剂处理土壤。结合耕翻整地用低毒广谱杀菌剂如多菌灵、代森锰锌、甲基托布津、高锰酸钾等药剂处理土壤。在耕翻或旋耕边地后，选用两种药剂兑水均匀喷雾垡面，然后再旋耕或耙捞第二边地。
5.农业措施以培育壮苗为中心。如适期适量播种，增施磷钾肥和锌肥，及时防治地下害虫，适时浇水补墒。水质差的区域应引河水灌溉或打深水井灌溉。
6.在小麦返青起身喷药控制。用恶霉灵、甲霜恶霉灵或戊唑醇、苯醚甲环唑、咯菌清、嘧菌酯等兑水顺垄喷雾，控制病害扩展蔓延。
7.清理病残体。在夏收或秋收时，将小麦秸杆或玉米秸杆清出病田外，不要再直接还田了。
小麦茎基病一旦发生，对小麦产量影响很大，越晚越难以防治，因此在日常的小麦田间管理期间，应做到早发现，早防治，选对药，减少危害，确保产量。