黄瓜出现苦味是因其植株内有一种叫苦味素的物质，该物质以黄瓜瓜柄基部含量高，并且可以遗传，其含量随蔬菜的类型、品种、栽培条件不同而不同。过量食用苦味瓜能使人出现呕吐、腹泻、痉挛等中毒症状。因此，在黄瓜栽培过程中，应采取必要措施，杜绝苦味瓜的形成，保证食用安全。主要措施如下：
避免低温或高温一是当气温或地温低于13℃时，细胞渗透性降低，养分和水分吸收受到抑制，黄瓜易出现苦味；二是大棚温度高于30℃且持续时间过长也会导致黄瓜发苦。因此要尽量增强保护设施的增温保温性能，调好温度，避开苦味形成的温度界限。
浇水应合理及时一是在气温较高、土壤水分较少的情况下，植株发生生理干旱，易产生苦味瓜。此时要及时给黄瓜供应水分，以保持植物组织的膨压、植株体温的稳定等。二是浇水应做到少量多次，水温不可过低，防止植株体内水分的亏缺导致黄瓜苦味素的形成。此外，特别注意定植后蹲苗不应过度，否则根瓜易苦。
施肥要平衡适量一是根部施肥。幼苗期应控制施用氮肥，避免植株徒长。到开花结果盛期，黄瓜对氮、磷、钾吸收的比例基本上是5∶2∶6，这个阶段要加强氮肥和钾肥的供应。二是根外追肥。在苗期、始花期、幼瓜期叶面喷施稀土微肥1次；在盛花期和盛果期每亩用尿素0.5公斤加水150公斤搅匀后进行叶面喷施。
密度不宜过大定植过密，光照不良，会导致黄瓜苦味加重。保护地黄瓜栽培应采用早期密植、后期稀植的方法，即普通株距26~30厘米，行距60厘米。若按15厘米株距定植，在同一垄上的“单株”不上架，当长到12片真叶时掐尖，可使其迅速结瓜，主蔓瓜采收完后拔掉，“复株”上架，当植株长到1.2米高时掐尖，使其加快结瓜，主蔓瓜采收完后也拔掉。这样栽培，早期产量能提高近1倍，同时也会减少苦味瓜的发生。
防止伤害根部伤根会使黄瓜苦味加重。生产上播种应用沙盘播种，起苗时尽量减少伤根，分苗应用塑料营养钵或纸口袋，栽培上应尽量采用垄作地膜覆盖栽培，铲地时应前期稍深，后期稍浅。
苦味瓜不能留种若将有苦味的黄瓜留瓜种，下一代生产出来的黄瓜，仍会有苦味。所以，在黄瓜将要成熟时，要取表层部分品尝，选择无苦味的留种。