据了解，无籽西瓜种子由于种胚发育不全、种皮较厚等原因，采用常规浸种催芽方法发芽率通常较低。采用以下方法可以提高发芽率。
1．选种。选择形状整齐，子粒饱满的种子，去掉秕粒、畸形粒和杂质。
2．浸种。将种子放在温度为20～30℃的水里浸泡2～4小时后捞出，用干净的布或毛巾搓掉种皮上的黏性物质，用清水冲一下，再用干净布或毛巾擦去种子表面的水分，稍晾干后破壳。
3．破壳。无籽西瓜种子催芽前必须破壳，未经破壳的种子发芽率仅为20％～30％，破壳后可提高到85％以上。一般用牙齿磕，使种子脐部缝合线裂开，只要听到“咔嚓”一声，嗑开种子长度的三分之一即可，不可用力过猛，以免损伤种胚影响发芽。也可以用钳子轻轻夹开种子，这样做起来又快又轻松。为避免夹坏种子，可以根据种子口大小，在钳子开口处垫一块小木块等硬物固定住。
4．催芽。与普通西瓜相比，无籽西瓜种子催芽温度要求较高，适宜温度为30～35℃。催芽时可以选用以下两种方法：（1）布卷催芽法。将粗布或毛巾放在温水里泡一下，拧干，把经破壳的种子平放在上面，从一端慢慢卷成布卷，使种子一层一层相互隔开，置于33～35℃的恒温下催芽。约过24小时，挑出芽长0.3～0.5厘米的种子放在阴凉处（不能受冻），剩下的继续催芽。再过12小时，有发芽能力的种子基本发芽。（2）沙床催芽法。准备好清洁的河沙，湿度以手捏紧指缝不出水为度。将经破壳的种子与等体积河沙拌匀，盛入盒中，放在30～33℃条件下催芽。湿沙要保持一定的湿度，能持续供水；种子相互隔开，不重叠，不堆积。催芽过程中不淋水。通常在16小时后种子开始萌发，24～36小时达到发芽高峰。经催芽后，芽（胚根）长以0.3～0.5厘米为宜，过长容易造成损伤，播种也困难。遇阴雨天等不利条件，经催芽的种子不能及时播种时，可拌湿沙放在15℃左右的地方，抑制芽生长。